每日焦點！我國科研團(tuán)隊構(gòu)建全球首個牧草圖形泛基因組

(相關(guān)資料圖)

3月14日筆者從四川農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，該校黃琳凱教授團(tuán)隊構(gòu)建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組，并揭示了狼尾草耐熱的分子機(jī)制，相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上。

美洲狼尾草，又名珍珠粟，全球種植面積約3100萬公頃。在我國，它是一種重要飼草。在研究過程中，黃琳凱團(tuán)隊聯(lián)合國內(nèi)外多家單位，從全球8個地區(qū)收集的394份美洲狼尾草核心種質(zhì)中選取了10份代表性材料，將基因組從頭組裝，獲得了高質(zhì)量的基因組組裝序列，并結(jié)合已報道的基因組構(gòu)建了首個美洲狼尾草圖形泛基因組，共發(fā)掘424085個結(jié)構(gòu)變異。

同時，基于對泛基因組圖譜進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，團(tuán)隊還發(fā)現(xiàn)了143個重要農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的變異位點，并挖掘到與產(chǎn)量性狀相關(guān)的候選基因446個。黃琳凱表示，與參考基因組相比，圖形泛基因組包含的遺傳信息更全面，通過發(fā)掘其中的結(jié)構(gòu)變異，能夠更好地解析植物表型和農(nóng)藝性狀的不同，為下一步育種奠定重要的研究基礎(chǔ)?！霸擁椦芯靠杉铀俟リP(guān)牧草業(yè)各環(huán)節(jié)‘卡脖子’技術(shù)，培育突破性牧草優(yōu)良品種，助力提升優(yōu)質(zhì)安全食物的供給保障能力，為國家糧食安全貢獻(xiàn)草業(yè)科研的力量。”她說。

美洲狼尾草高質(zhì)量基因組組裝和泛基因組分析。受訪者供圖

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