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焦點!青島能源所解析米卡芬凈前體合成機制


(資料圖片僅供參考)

3月10日,科技日報記者從中國科學院青島生物能源與過程研究所(以下簡稱“青島能源所”)獲悉,該所研究團隊解析了環(huán)脂肽類天然產物FR901379的完整生物合成途徑和調控機制,尤其是詳細闡明了磺酰化形成機制,在此基礎上通過代謝工程改造,顯著提高了工業(yè)菌株的發(fā)酵性能,并基于磺酰化模塊創(chuàng)制了水溶性提高數(shù)千倍的新型磺?;拙仡惢衔铩O嚓P成果發(fā)表于《代謝工程》和《微生物細胞工廠》。

棘白菌素類抗真菌藥物是治療深部真菌感染的一線臨床用藥,其中米卡芬凈因存在天然磺?;揎椌哂泻芎玫乃苄浴<绘呙拱l(fā)酵生產的環(huán)脂肽類天然產物FR901379是米卡芬凈工業(yè)生產的前體化合物,其發(fā)酵效率低使得米卡芬凈生產成本居高不下,限制了米卡芬凈的市場應用。解析FR901379生物合成機制,開展工業(yè)菌株理性改造是提高米卡芬凈生產效率的重要研究方向。

FR901379合成調控機制解析及其應用。黃雪年?門萍制圖

研究團隊首先對FR901379合成基因簇進行了生物信息學預測,通過基因敲除進行了系統(tǒng)驗證并提出FR901379環(huán)脂肽骨架的生物合成途徑;利用HMMER構建隱馬爾可夫模型預測同源基因,并結合差異轉錄組數(shù)據(jù)篩選可能負責氧磺?;鶊F合成的候選基因。體內敲除和體外酶活結果表明,氧磺酰化修飾是由細胞色素P450酶McfP和磺?;D移酶McfS在環(huán)脂肽后修飾階段完成的。

闡明FR901379生物合成機制后,研究團隊針對棘腔孢霉發(fā)酵過程中存在產量低、副產物難分離等問題,開展了系統(tǒng)的工業(yè)菌株理性改造研究,使FR901379合成途徑全面上調,搖瓶產量也提高了3倍。為了減少因氧化不充分導致的中間產物積累,團隊對關鍵的后修飾限速酶McfF和McfH進行過表達,合成途徑優(yōu)化后副產物含量減少80%以上,產量也進一步顯著提高,最終在5L發(fā)酵罐中產量達到4.0g/L,高于現(xiàn)有工業(yè)水平。

磺?;鶊F能夠增加化合物的水溶性,進而增加藥物的生物利用度,為了創(chuàng)制更多的磺酰化棘白菌素類化合物,研究團隊將磺酰化模塊在抗真菌藥物卡泊芬凈前體(紐莫康定B0)生產菌株中進行了異源重構,成功獲得了氧磺酰化紐莫康定B0,其水溶性提高了4000多倍,該研究為創(chuàng)制更多磺?;拙仡惢衔锾峁┝嗣笇W元件和可行性驗證。

該研究完整解析了FR901379的生物合成機制,在此基礎上對FR901379合成途徑的適配性進行了優(yōu)化,并創(chuàng)制了水溶性的新型磺酰化棘白菌素類化合物,為米卡芬凈生產工藝提質增效奠定了基礎,同時也為藥物水溶性提高提供了新思路。

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